Заштићени биотопи су станишта за одређене врсте биљака и животиња. Ова станишта заслужују посебну заштиту јер су ретка, имају велику еколошку вредност и/или су угрожена уништењем.

Постоје закони и међународни споразуми који штите ова станишта. У Доњој Саксонији, следеће врсте биотопа стављене су под посебну правну заштиту према члану 30. Закона о заштити природе и управљању пејзажом (BNatSchG):

• природна или приrodно-слична подручја текућих и мирних унутрашњих вода, укључујући њихове обале и повезану природну или приrodно-сличну вегетацију дуж обала, као и њихова природна или приrodно-слична замуљена подручја, заливска језера и редовно поплављена подручја,
• торњеве, мочваре, тршћаци, велике заједнице врбе, влажне ливаде богате врбама и шибљима, изворишта, унутрашње солене,
• отворене унутрашње дине, отворена природна поља великана, шљунковити и каменити нагиби, кречњачке литице, пашњаци патуљастог жбуња, метле и тиса, пашњаци са травом у тепиху, суве пашњаке, пашњаке отпорне на тешке метале, шуме и жбуње у топлим, сувим стаништима,
• поплавна раван, мочваре и алувијалне шуме, клисура, шуме на пољима великана и шљунковитим падинама, субалпске шуме липе и липе са швајцарским кестеном,
• отворене стеновите формације, пећине и полуприродни тунели, алпске ливаде, долине пуне снега и жбунски облици патуљкасте боровине,
• стеновите и стрме обале, приобалне динe и гребени плажа, приобална језера, лагуне са затрпаним деловима, слане мочваре и блатне равни у приобалним подручјима, лежишта морских трава и друге заједнице морских макрофита, гребени, сублиторалне пешчане баре, муљевити наноси са бурећим мегафауном, као и лежишта шљунка, крупног песка и шкриљца богата врстама у морским и приобалним подручјима,
• низинске траварске ливаде сиромашне хранљивим материјама и планинске траварске ливаде како је дефинисано у Анексу I Директиве 92/43/ЕЕЦ, воћњачке ливаде, камене живе ограде и суве камене ограде.

Поред тога, у складу са чланом 24 Закона о заштити природе Доње Саксоније (NNatSchG), следеће типове станишта обухвата посебна правна заштита:

• влажне ливаде богате високим вишегодишњим биљкама и друга станишта богата врстама у влажним и влажним травњацима,
• планинске ливаде,
• мезофитна ливада,
• ливаде и пашњаци са воћкама који покривају површину већу од 2.500 ^{м² и састоје}се од стандардних воћки са висином стабла већом од 1,60 м (расути воћњаци) и
• увала.

Заштита других биотопа може проистицати из специфичног законодавства осмишљеног за заштиту одређених подручја.

Забрањене су радње које могу довести до уништења или значајног нарушавања ових станишта, укључујући њихову карактеристичну флору и фауну. Изузеци се могу дозволити појединачно, ако се штетни ефекти могу отклонити. Оштећење и уништавање посебно заштићених биотопа, чак и ако су проузроковани незнањем, су незаконити. Одговорна страна може бити обавезана да поврати површину у првобитно стање.

Правно заштићене биотопе утврђују локална самоуправа, заједничка локална самоуправа и град и уписују се у регистар заштићених делова природе и пејзажа. Власници и овлашћени корисници се писмено обавештавају о њиховом укључивању у овај регистар. Локалне самоуправе, заједничке локалне самоуправе и општине воде изводе из овог регистра. Сви могу да прегледају овај регистар и изводе у складу са NAGBNatSchG.