Les premières traces de colonisation remontent déjà aux alentours de la naissance du Christ : à peine à l'ouest de la localité actuelle, en bordure du cours d'eau Holzriede, plusieurs campagnes de fouilles menées dans les années 1950 ont permis de mettre au jour un village datant de l'Empire romain et de récupérer un four de course qui prouve que l'on travaillait déjà le minerai de fer dans la région au troisième siècle après Jésus-Christ.

Lobmachtersen a d'abord fait partie de l'office de Lichtenberg, qui comptait au 15e siècle, avec 27 villages au total, l'un des plus grands offices de la principauté de Braunschweig-Wolfenbüttel. En 1542, Lobmachtersen et les villages voisins de Calbecht et Leinde furent rattachés à l'office de Gebhardshagen. C'est de cette époque que datent les premières informations sur les habitants du village. Le registre des successions de l'office de Gebhardshagen datant de 1548 mentionne pour la première fois le nom des propriétaires des six fermes agricoles, des deux fermes de demi-fourrage et des 33 fermes de fourrage.

Au milieu du 19e siècle, l'industrialisation a changé la physionomie de Lobmachtersen. Dès 1849, une briqueterie a été construite pour exploiter les gisements d'argile à la périphérie ouest du village, suivie en 1870 par une autre briqueterie qui a fonctionné jusqu'au 20e siècle. Lobmachtersen est en outre le seul quartier de Salzgitter à pouvoir se targuer d'avoir un château d'eau : une usine de production d'eau avec une tour et un réseau de conduites circulaires a été construite en 1928 et a fonctionné jusqu'en 1982. Aujourd'hui, le château d'eau de près de 30 mètres de haut est un symbole de ce quartier de 800 habitants, et une association de soutien s'occupe de sa préservation.

La construction des usines du Reich Hermann Göring n'a tout d'abord guère eu de conséquences directes sur Lobmachtersen, qui a été rattaché le 1er avril 1942 à la ville nouvellement formée de Watenstedt-Salzgitter. La période d'après-guerre fut également marquée à Lobmachtersen par la difficulté de devoir héberger des réfugiés et des personnes déplacées en grand nombre : la population doubla presque, la situation alimentaire était difficile, de petites parcelles furent aménagées aux abords du village pour cultiver des légumes et des pommes de terre.

La vie sociale du quartier est aujourd'hui marquée par différentes associations et groupes. Outre l'association de promotion du château d'eau, les pompiers volontaires, l'association de chant Machterscher Kontrapunkt et les Kyffhäuser jouent un rôle important.