Перші сліди поселення відносяться до часів приблизно до Різдва Христового: трохи на захід від сучасного села, на березі струмка Гольцріде, під час кількох розкопок у 1950-х роках було знайдено поселення часів Римської імперії та віднайдено горн, який доводить, що залізну руду в цьому регіоні переробляли вже у ІІІ столітті нашої ери.
Спочатку Лобмахтерсен належав до району Ліхтенберг, який у 15 столітті був одним з найбільших районів князівства Брауншвейг-Вольфенбюттель і налічував 27 сіл. У 1542 році Лобмахтерсен та сусідні села Кальбехт і Ляйнде були приєднані до управління Гебхардсхагена. До цього часу відносяться перші відомості про мешканців села. У реєстрі спадщини відомства Гебхардсхаген від 1548 року вперше поіменно згадуються власники шести орних, двох напівкінних і 33 гнойових господарств.
У середині 19 століття індустріалізація змінила вигляд Лобмахтерсена. Вже у 1849 році для розробки покладів глини на західній околиці села було збудовано цегельний завод, а у 1870 році - ще один цегельний завод, який продовжував працювати у 20-му столітті. Лобмахтерсен також є єдиним районом Зальцгіттера, який може назвати водонапірну вежу своєю: водонапірна станція з вежею і кільцевою магістраллю була побудована в 1928 році і працювала до 1982 року. Сьогодні майже 30-метрова водонапірна вежа є визначною пам'яткою району, населення якого становить трохи більше 800 осіб, і який обслуговується допоміжною асоціацією.
Створення Рейхсверу Германа Герінга спочатку мало незначний безпосередній вплив на Лобмахтерсен, який 1 квітня 1942 року був приєднаний до новоствореного міста Ватенштедт-Зальцгіттер. Повоєнний період для Лобмахтерсена також характеризувався труднощами, пов'язаними з необхідністю прийняти велику кількість біженців і переміщених осіб: населення майже подвоїлося, ситуація з продовольством була складною, і на околицях села були розбиті невеликі земельні ділянки для вирощування овочів і картоплі.
Сьогодні соціальне життя в районі характеризується різноманітними клубами та групами. Окрім асоціації з просування водонапірної вежі, важливу роль відіграють добровільна пожежна команда, хорове товариство "Машинобудівельник" та "Кіфгаузер".