Первые следы поселения относятся ко времени около Рождества Христова: чуть западнее сегодняшней деревни, на берегу ручья Хольцриде, в ходе нескольких раскопок 1950-х годов было обнаружено поселение времен Римской империи и найдена печь для обжига, что доказывает, что железную руду в этом регионе обрабатывали уже в III веке нашей эры.
Изначально Лобмахтерсен относился к району Лихтенберг, который в XV веке был одним из крупнейших районов княжества Брауншвейг-Вольфенбюттель с 27 деревнями. В 1542 году Лобмахтерсен и соседние деревни Кальбехт и Ляйнде были отнесены к ведомству Гебхардсхагена. Первые сведения о жителях деревни относятся к этому времени. В реестре наследства Гебхардсхагенского управления от 1548 года впервые упоминаются по именам владельцы шести пахотных, двух полулошадиных и 33 навозных ферм.
В середине XIX века индустриализация изменила облик Лобмахтерсена. Уже в 1849 году был построен кирпичный завод для разработки залежей глины на западной окраине деревни, а в 1870 году - еще один кирпичный завод, который продолжал работать и в XX веке. Лобмахтерсен - единственный район в Зальцгиттере, который может назвать водонапорную башню своей собственностью: водонапорный завод с башней и кольцевой магистралью был построен в 1928 году и действовал до 1982 года. Сегодня водонапорная башня высотой почти 30 метров является достопримечательностью района с населением около 800 человек и обслуживается ассоциацией поддержки.
Создание Рейхсверке Германа Геринга первоначально не оказало непосредственного влияния на Лобмахтерсен, который 1 апреля 1942 года был включен в состав новообразованного города Ватенштедт-Зальцгиттер. Послевоенный период в Лобмахтерсене также характеризовался трудностями, связанными с размещением большого количества беженцев и перемещенных лиц: население увеличилось почти вдвое, ситуация с продовольствием была сложной, и на окраинах деревни были разбиты небольшие участки земли для выращивания овощей и картофеля.
Сегодня общественная жизнь района характеризуется наличием различных клубов и групп. Помимо ассоциации по развитию водонапорной башни, важную роль играют добровольная пожарная дружина, хоровое общество Machterscher Kontrapunkt и Kyffhäuser.
