Avec la directive FFH, les États membres de l'UE se sont engagés à créer le réseau écologique NATURA 2000. Pour ce faire, ils doivent désigner, protéger et, si nécessaire, développer certaines zones. La directive définit les bases techniques et les procédures nécessaires à cet effet.
La directive européenne sur la protection des oiseaux, adoptée dès 1979, contient des dispositions comparables, mais qui se rapportent exclusivement aux espèces d'oiseaux.
Les zones protégées créées en vertu de ces deux directives forment le réseau NATURA 2000.
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